Dikson, Dikson (2018) Penggunaan pembelajaran mesin dalam pembangunan model aktivitas optimal enzim endoxilanase = Utilization of Machine Learning for Establishing Model of Endoxylanase Optimal Activity. Bachelor thesis, Universitas Pelita Harapan.
![Title [thumbnail of Title]](http://repository.uph.edu/style/images/fileicons/text.png)
Title.pdf
Restricted to Registered users only
Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial Share Alike.
Download (1MB)
Preview
Abstract.pdf
Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial Share Alike.
Download (341kB) | Preview
Preview
ToC.pdf
Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial Share Alike.
Download (352kB) | Preview
Preview
Chapter1.pdf
Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial Share Alike.
Download (344kB) | Preview
![Chapter2 [thumbnail of Chapter2]](http://repository.uph.edu/style/images/fileicons/text.png)
Chapter2.pdf
Restricted to Registered users only
Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial Share Alike.
Download (633kB)
![Chapter3 [thumbnail of Chapter3]](http://repository.uph.edu/style/images/fileicons/text.png)
Chapter3.pdf
Restricted to Registered users only
Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial Share Alike.
Download (450kB)
![Chapter4 [thumbnail of Chapter4]](http://repository.uph.edu/style/images/fileicons/text.png)
Chapter4.pdf
Restricted to Registered users only
Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial Share Alike.
Download (366kB)
![Chapter5 [thumbnail of Chapter5]](http://repository.uph.edu/style/images/fileicons/text.png)
Chapter5.pdf
Restricted to Registered users only
Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial Share Alike.
Download (218kB)
![Bibliography [thumbnail of Bibliography]](http://repository.uph.edu/style/images/fileicons/text.png)
Bibliography.pdf
Restricted to Registered users only
Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial Share Alike.
Download (363kB)
![Appendices [thumbnail of Appendices]](http://repository.uph.edu/style/images/fileicons/text.png)
Appendices.pdf
Restricted to Repository staff only
Available under License Creative Commons Attribution Non-commercial Share Alike.
Download (895kB)
Abstract
Endoxilanase merupakan enzim yang berasal dari keluarga Glikosil Hidrolase 11
yang mampu menghidrolisis ikatan 1,4-β-xilosida diantara residu xilosa dalam
rantai xilan. Endoxilanase telah dipelajari akan sifat dan aktivitas optimal, dan
diterapkan dalam beragam jenis kebutuhan industri. Dalam pencarian varietas
endoxilanase baru, aktivitas optimal enzim dicari secara konvensional di laboratorium basah, yang mungkin memerlukan waktu dan dana yang besar. Pembelajaran mesin ditawarkan sebagai alternatif yang murah dan cepat untuk memprediksikan aktivitas optimal endoxilanase berdasarkan dari data pada basis data UniProtKB dan BRENDA, menggunakan algoritma regresi logistik yang dapat digunakan untuk data biologis seperti urutan asam amino enzim untuk klasifikasi. Model pra-optimisasi menghasilkan tingkat akurasi 67% untuk suhu optimal dan 93% untuk kingdom, sementara model pasca-optimisasi menghasilkan tingkat akurasi 73% untuk suhu optimal dan 93% untuk kingdom. Namun demikian, hasil validasi silang menandakan variasi yang luas pada tingkat akurasi yang dihasilkan oleh model tersebut, yang menandakan model mengalami overfitting. Hal tersebut diduga diakibatkan oleh jumlah data yang terbatas, ataupun data tersebut masih terlalu rumit untuk algoritma untuk membangun model yang umum. Tindakan lebih lanjut perlu dilakukan untuk memperbaiki algoritma dan pengolahan data, walaupun pembelajaran mesin terbukti mampu untuk menganalisis urutan asam amino enzim endoxilanase dan memprediksikan aktivitas optimalnya.
Item Type: | Thesis (Bachelor) |
---|---|
Creators: | Creators NIM Email ORCID Dikson, Dikson NIM00000004809 UNSPECIFIED UNSPECIFIED |
Contributors: | Contribution Contributors NIDN/NIDK Email Thesis advisor Pinontoan, Reinhard NIDN0325046502 UNSPECIFIED Thesis advisor Gotama, Michael UNSPECIFIED UNSPECIFIED |
Additional Information: | SK 113-14 DIK p 2018; 31001000176827 |
Uncontrolled Keywords: | Enzyme; endoxylanase; machine learning |
Subjects: | Q Science > QH Natural history > QH301 Biology |
Divisions: | University Subject > Current > Faculty/School - UPH Karawaci > Faculty of Science and Technology > Biology Current > Faculty/School - UPH Karawaci > Faculty of Science and Technology > Biology |
Depositing User: | Mrs Veronica Fitri Astuti |
Date Deposited: | 15 May 2021 14:39 |
Last Modified: | 03 Apr 2024 11:22 |
URI: | http://repository.uph.edu/id/eprint/26468 |